Merkezde iş ve işlemler; Hukuk Müşavirliği, Teftiş Kurulu Başkanlığı, Personel ve İdari İşler Müdürlüğü, Vakıf Muhasebe Müdürlüğü, Hac ve Umre Muhasebe Müdürlüğü, İnşaat ve Emlak Müdürlüğü, Eğitim Kültür ve Sosyal Hizmetler Müdürlüğü, Dış İlişkiler Müdürlüğü, Levazım Müdürlüğü, Bilgi İşlem Merkezi Müdürlüğü olmak üzere toplam 10 birimde yürütülmektedir.
Çok geniş bir hizmet alanı bulunan Vakfın, hizmetlerinin daha verimli yürütülebilmesi için teşekkül ettirilen tüm il ve ilçe şubeleri, Vakfımız genel merkez hizmetlerinin benzerlerini yürütmektedir.